违法用海案件实行属地管理，由违法行为发生地的海洋综合执法队伍负责查办，上级海洋综合执法队伍负责监督指导。对于案情重大、复杂和无正当理由超过办案期限的案件，省级海洋综合执法队伍可以指定其上一级海洋综合执法队伍立案查处，或者直接立案查处；有管辖权的海洋综合执法队伍出现下列情形难以行使管辖权的，可以按程序报请上一级海洋行政主管部门直接管辖：

　　（一）违法主体为本级政府部门的；

　　（二）案情复杂或者情节恶劣的，需要上级海洋综合执法队伍查处的。

　　对存在管辖争议的案件，报请共同的上一级海洋综合执法队伍指定管辖。上一级海洋综合执法队伍应当在接到指定管辖申请之日起七个工作日内，作出管辖决定。