认定违法主体是办理违法用海案件的重要环节。对现场检查未发现当事人的，要对违法项目进行全面调查，走访周边群众、询问所在地基层政府及村委（居委）、通过适当形式发布公告，穷尽一切调查手段仍无法查明当事人的，应对该区域进行严格监管，禁止开发利用，并将有关情况上报主管部门和当地政府，恢复海域原状。