直属二支队为广东省海洋综合执法总队派出行政执法机构，加挂广东省海洋综合执法总队粤中巡航执法基地牌子，主要承担海上维权相关执法工作；组织开展跨区域海洋综合执法行动，支持、协助和指导市县海洋综合执法机构海洋综合执法工作；根据授权调查处理重大涉海违法违规案件。